Проректор по научной работе МИЭТ осуществляет непосредственное оперативное руководство следующими подразделениями:

• Научно-исследовательской институт электронной техники
• Научно-исследовательский институт нанотехнологии
• Центр коллективного пользования «Микросистемная техника и электронная компонентная база»
• Проектный офис
• Отдел докторантуры и аспирантуры
• Отдел научно-технической информации
• Отдел содействия научным исследованиям
• Группа выставочной деятельности
• Экспертная группа
• Сектор технической эстетики
• Издательско-полиграфический комплекс
• Информационно-аналитический центр